基因不是答案，而是问题的开始
2000年6月26日，时任美国总统的比尔·克林顿宣布，科学家绘制了第一幅人类基因组序列草图。也就是说，他们推导出了构成人类DNA（脱氧核糖核酸）的基本化学构件（约30亿个碱基对）是按照何种顺序串联在一起的。克林顿说：“此时此刻，我们正在学习上帝创造生命的语言。
基因组
EasyNanoMeta | 纳米孔宏基因组5纳米孔宏基因组组装方法
引文：Kai Peng, Yunyun Gao, Changan Li, Qiaojun Wang, Yi Yin, Muhammad Fazal Hameed, Edward Feil, Sheng Chen, Zhiqiang Wang, Yong-Xin
纳米孔 基因组 con easynanometa 基因组组装 2025-08-28 20:36 4
机器学习揭示进化不是随机的，而是可以预测：“无异于革命性的”
达尔文进化论的核心观点——随机突变加自然选择——正面临来自计算生物学的重大挑战。诺丁汉大学和诺丁汉特伦特大学的联合研究团队利用机器学习技术分析了数千个大肠杆菌基因组，发现基因的获得和丢失并非完全随机，而是遵循可预测的模式。这项发表在《美国国家科学院院刊》的研究
【知识分享】基因组时代的植物迁地保护
随着人类社会和经济的快速发展，气候变化等因素促使全球生物多样性急剧丧失。植物是生物多样性的核心组成部分，通过迁地保护来拯救濒危植物已经成为植物园的核心工作。总结了基因组测序技术对植物保护的发展和迁地保护的成效与现状，基因组技术为准确识别濒危植物的分类地位、探索
人体“第二基因组”竟能增强抗癌疗效！调节肠菌开启治疗新大门
你知道吗？我们的身体里居住着一支“万亿级隐形战队”—— 人体微生物群！它们的总数量甚至超过人体细胞总和。这些肉眼看不见的 “居民” 并非简单的 “寄生者”，而是与人体共生共荣的 “生命伙伴”，时刻参与着消化、代谢乃至免疫调节等关键生命活动！
重磅！中国人群规模最大的肺癌全基因组关联研究，13，722例全基因组测序（WGS）揭示东亚人群肺癌致病新机制
肺癌是全球及中国的“头号癌症杀手”——据世界卫生组织统计，每年约180万人因肺癌死亡，在中国，其发病率和死亡率均居恶性肿瘤之首。尽管近年来基因组学研究已揭示部分肺癌相关基因，但占基因组97%以上的非编码区域（曾被视为“垃圾DNA”）如何调控肺癌发生，仍是科学界
史上最小基因组生物挑战生命定义：古菌与病毒界限模糊
生物学教科书可能需要重新编写。达尔豪斯大学研究团队在日本海岸浮游生物体内发现了一种极其特殊的微生物，其基因组仅包含238,000个碱基对，打破了细胞生物最小基因组纪录，并以一种前所未见的生存方式挑战着科学界对生命本质的认知。这种被命名为Sukunaarchae
古基因组揭示西周人群是二里头中原古人后裔
古基因组学研究为探索华夏文明起源提供了革命性证据。本文整合Li et al. (2021)、Wang et al. (2022)及Zhang et al. (2021)等多项研究数据，通过常染色体祖源分析、Y染色体单倍群追踪及跨遗址遗传距离计算，系统论证西周人
Nature报道：谷歌新模型1秒读懂DNA变异！首次统一基因组全任务
模型架构受U-Net启发，可以将1兆碱基的DNA输入序列，在下采样阶段处理为两种类型的序列表达，分别是对应线性基因组的一维嵌入（1bp和128bp分辨率），和对应基因组片段空间相互作用的二维嵌入（2048bp分辨率）。
五天破解身体密码，他们从30亿个碱基对中提炼出“中国方案”｜寻访福田“小巨人”
“人工智能时代，生命也可以进行数字化。”微基因创始人兼CEO陈钢如是说道。人体基因组包含大约30亿个碱基对，约2万至2.5万个基因，每个基因都有其特定的位置，构成人体的“身体密码”。
学者完成三种药用甘草的高质量参考基因组
近日，中国科学院华南植物园研究员王瑛团队联合海南大学教授夏志强团队，在广东省自然科学基金面上项目等的资助下，完成了三种药用甘草的高质量参考基因组，助力甘草的遗传育种。相关成果发表于《植物杂志》（The Plant journal）。
DNA语言模型以单核苷酸分辨率对植物基因组跨物种建模
为了解决这一问题，康奈尔大学的研究人员推出了 plantCaduceus，这是一个利用独特架构并在多种被子植物基因组上进行预训练的 DNA 语言模型。
颠覆“中国起源说”：基因组研究证实赤小豆栽培发祥于日本
农业食品产业技术综合研究机构（位于茨城県筑波市）与台湾大学的研究团队通过基因组分析证实，制作红豆饭与和果子馅料不可或缺的赤小豆，其栽培起源可追溯至日本绳文时代。这项研究推翻了“赤小豆与水稻、麦类同样是在弥生时代从中国大陆传入”的传统观点，相关论文已发表于美国《
Nature丨天然核小体自带指导三维基因组组装的信息
细胞核基因组主要分为两大区域：基因丰富且相对开放的常染色质，以及基因稀少且相对致密的异染色质。随着Hi-C染色质构象捕获和染色质追踪等技术的出现，基因组的复杂层级组织结构正逐渐被揭示。每条染色体在细胞核内占据独立区域，其基因组可以人为划分为两个区室结构——A/
Nature Methods | 长读长测序“去伪存真”：SAVANA如何颠覆癌症基因组分析的传统认知？
癌细胞并非静止不变，它们的基因组在不断上演着一场场惊心动魄的“结构变形记”？这些被称为体细胞结构变异（somatic structural variants, SVs）和体细胞拷贝数变异（somatic copy number aberrations, SCN
Nature Genetics丨人类原发性癌症的三维基因组图谱
在每个人体细胞中， 2 m 的 DNA 广泛折叠在 ~10 µm 的细胞核内。真核基因组在三维空间中按层次组织，以便通过远端顺式调控元件进行转录调控。染色体细分为多兆碱基 （ Mb ） A 和 B 区室，它们以同型方式相互作用，分别富含 常 染色质和异染色质。
癌症 基因组图谱 基因组 ge naturegenetics 2025-06-02 08:41 11
肖军研究组开发三维基因组新技术并揭示TaSPL7&15介导染色质互作调控光合作用的机制
染色质的空间组织结构是维持基因组稳定性、实现基因表达精准调控关键环节。在植物中，已有诸多参与调控关键农艺性状的远程调控元件被鉴定。然而，现有三维染色质构象捕获技术（如Hi-C, ChIA-PET, HiChiP和OCEAN-C等）仍难以在低成本条件下无偏好性地
古基因组研究揭示青藏高原人群“幽灵祖先”之谜
30日，《科学》杂志在线发表了一项关于东亚和东南亚族群探源的突破性研究成果。来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、云南省文物考古研究所等单位的科研人员，利用古DNA技术开启了一趟寻根之旅，历经9年艰辛探索，成功破解了青藏高原人群“幽灵祖先”之谜，并首次揭示南
黑箱渐开：表观基因组如何绘制胚胎发育蓝图
从精卵结合那一刻起，一个微小的单细胞合子（zygote），是如何被赋予了创造万物的无限潜能，又如何在最初的几天内，一步步精准地搭建起复杂生命的蓝图，最终孕育出我们自身？
Nature Genetics丨全基因组关联分析揭示强迫症的30个风险基因位点
强迫症（Obsessive-Compulsive Disorder, OCD）是一种常见的精神障碍，全球约1%-3%的人口受其影响。患者会经历反复出现的强迫思维和强迫行为，严重影响生活质量，甚至增加自杀风险。尽管环境因素（如压力或创伤）可能诱发OCD，但研究表
强迫症 基因组 基因组关联 基 naturegenetics 2025-05-26 19:44 9